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元智大學及南華大學修正不分系的政策，證明在台灣，實施一、二年級不分系，有其結構性的限制存在。

實施一、二年級不分系，代表一、二年級的課程必須能排出橫貫人文、社會、理工等各大領域的通識課。要開出如此多元的課程，如果不是學系發展均衡的大學，如何能夠？試問，台灣數十年來已專業化太深的大學，又有幾所能夠？

最重要的還在於通識課如何授課的問題。以一、二年級不分系最有名的芝加哥大學及哈佛大學來說，通識課是必須扎扎實實打造的基礎課程，每一門課要求學生必須研讀的書籍及原典更不知凡幾。然而，通識在台灣早已變成營養學分，又有那幾個學校，能如美國名校般，透過深入的閱讀及討論，訓練學生如何挖掘及思考人類社會所面對的種種議題？

當前各校科系，歷經教育部規範及歷史發展，都已具備固定的學生及師資員額。一、二年級不分系的後續發展，就是三、四年級的學生決定主修領域，以台灣熱門科系的社會價值觀，最可能的發展是少數科系獨大，其他科系奄奄一息！

學校在這種情況下，是該讓這些熱門科系多聘請老師，愈來愈大？讓其他科系自然解散、老師回家？但那一天風潮轉變，該怎麼辦？如果不思考清楚，只形式地推出一些不三不四的制度，又產生一堆不預期的後果，以後該如何善後？